有机肥是土壤改良的主要动力，有机质转化为腐殖质后可促进团粒结构数量的增加，对养分的转化吸收和维护土壤理化性状有良好的效果。而据了解，超量使用有机肥仅仅是个别现象，大多数棚户有机肥的用量普遍不足。

    为了保证底肥能充足的供应蔬菜整个生育期生长的营养，底肥中常采取有机肥混加化学肥料的方法。通常把所需磷肥的100%、钾肥的20%-50%、氮肥的30%-50%混入有机肥中一并施入。化肥的用量要根据所使用有机肥的质量和数量做相应的调整。

    在底肥中添加生物菌肥是底肥施用的一个趋势，在土壤中就是依靠微生物来达到有机肥的分解和各种养分的转化。底肥中混加生物菌肥一方面可更好地改良土壤，提高养分的吸收利用率；另一方面生物菌肥可起到以菌抑菌预防根部病害以及重茬危害的效果，减少了因根部问题带来的农药投入。

    蔬菜栽培中，中微量元素不可缺少。由于地域不同，土壤中中微量元素的含量不一样，应及时进行测土了解土壤中中微量元素的丰缺情况。

    通常情况下，底肥中需要施入的微量元素为钙肥、硼肥以及铁锌肥料等等。在施用中微肥的时候需要注意，要购买使用有效的肥料产品。

    通常来说，底肥是伴随着土壤翻耕施入的，要想底肥效果达到最佳，就需要注意底肥的施用方式。首先，底肥要深施。一般旋耕机翻地深度在20厘米左右，往往会造成地表养分富集的情况。蔬菜根系都有向肥性，在定植以后根系会随着肥料扩展延伸，大量根系集中于土壤20厘米左右，既影响蔬菜长势，也会降低植株的抗性，进入冬季的时候很容易受到低温伤害。其次，在底肥量少时可采取沟施、畦施等方式，而底肥用量大时一定要全棚深翻。